بررسی برهم کنش بین نانوعملگر پریفولدینی و محموله بیماری زای دیمر آمیلوئید بتا به روش دینامیک مولکولی

بیماری آلزایمر شایع ترین نوع زوال عقل است. پپتید های آمیلوئید بتا نقش کلیدی را در آسیب شناسی بیماری آلزایمر عهده دار هستند و تحقیقات اخیر نشان داده است که الیگومرهای آمیلوئید بتا سمی ترین جز آن هستند. در بین الیگومرها، نوع دیمر با توجه به ماندگاری بالا در مقایسه با دیگر انواع، دارای اثرات سمی بیشتری می باشد. پریفولدین یک چپرون مولکولی است که از تجمع پروتئین هایی که اشتباه تاخورده اند جلوگیری کرده و نشان داده شده است که می تواند به عنوان یک نانوعملگر نیز ایفای نقش کند. در اینجا ما به بررسی برهم کنش بین نانوعملگر پریفولدینی و نانو محموله بیماری زا دیمر در ابعاد مولکولی پرداختیم که بدین منظور شبیه سازی دینامیک مولکولی تمام اتم در محیط حلال صریح در دمای فیزیولوژیک انجام گرفت. بعد از تصویرسازی از نتایج و همچنین بررسی فواصل اتمی بین اتم های نانوعملگر و محموله بیماری زا مشخص شد که دو بازو از شش بازوی عملگر توانسته اند محموله را در برگیرند و با آن در طول مدت زمان شبیه سازی، پیوندهای هیدروژنی برقرار کنند. همچنین با بررسی اثرات آب گریزی بین آمینواسیدهای آب گریز در محموله و نانوعملگر مشخص شد آب گریزی تأثیر مثبتی در پایداری اتصال دو بازوی پیوند یافته با محموله داشته است. پژوهش حاضر، پریفولدین را به عنوان یک عامل مهارکننده برای الیگومر نوع دیمر از آمیلوئید بتا معرفی می کند که می تواند در درمان بیماری آلزایمر بسیار مؤثر باشد.